Es verkehren keine S-Bahnen im Abschnitt zwischen Pasing und Laim, im Regionalverkehr kommt es teilweise zu Ausfällen zwischen Pasing und Hauptbahnhof. Für Fahrgäste von S-Bahn und Regionalverkehr ist ein SEV mit Bussen zwischen Pasing und Laim unterwegs. Der SEV fährt überwiegend im 5-Minuten-Takt, in den Randzeiten alle 10 Minuten. Außerdem ist die Tram 19 auf Bestellung der S-Bahn mit mehr Fahrten im Einsatz.

Auf der Schiene verkehren nur die S1 und S2 ohne Einschränkungen. Die S2 West ist dabei tagsüber verstärkt unterwegs und fährt im 10-Minuten-Takt – auch durch die Stammstrecke. Die S7 fährt ebenfalls durch die Stammstrecke, hier ist allerdings ein Umstieg am Ostbahnhof erforderlich. Nachfolgend die Details:

• S1 verkehrt ohne Einschränkungen.
• S2 verkehrt ohne Einschränkungen und fährt Samstag und Sonntag von ca. 8.00 bis 21.10 Uhr zwischen Dachau und Ostbahnhof im 10-Minuten-Takt.
• S3 entfällt zwischen Pasing und Hackerbrücke (tagsüber) / Laim (nachts).
• S4 entfällt zwischen Pasing und Trudering.
• S6 + S7 tauschen am Ostbahnhof die Liniennummer: Züge der S6 aus Richtung Ebersberg fahren ab Ostbahnhof umsteigefrei weiter als S7 nach Wolfratshausen. S7-Züge der Gegenrichtung aus Wolfratshausen fahren ab Ostbahnhof weiter als S6 nach Ebersberg. Im Westen fährt die Linie S6 nur ab/bis Pasing und entfällt somit zwischen Pasing und Ostbahnhof. Züge der S7 aus Richtung Osten wenden am Ostbahnhof.
• S8 entfällt zwischen Pasing und Johanneskirchen (zwischen Ostbahnhof und Johanneskirchen besteht SEV wegen Oberleitungsarbeiten auf der S8).