Für das turnusmäßige Instandhaltungswochenende sowie Arbeiten für die 2. Stammstrecke in Laim und am Ostbahnhof sind die gesamte Stammstrecke sowie die S-Bahn-Gleise rund um den Ostbahnhof einschließlich Leuchtenbergring und Berg am Laim gesperrt. Zwischen Pasing im Westen sowie Trudering, Riem und Giesing im Osten sind dann keine Züge auf den S-Bahn-Gleisen unterwegs. Nur die S8 fährt den Ostbahnhof an. Betroffen sind davon alle Linien außer der S7:

• S1: Fährt nur zwischen Freising/Flughafen und Hauptbahnhof (ab/bis Moosach ohne Zwischenhalt und nur alle 20 bis 40 Minuten).
• S2: Fährt im westlichen Bereich im Halbstundentakt zwischen Petershausen und Heimeranplatz (U5) sowie als Pendelverkehr im regulären Takt zwischen Altomünster und Dachau. Im östlichen Bereich fährt die S2 nur zwischen Riem und Erding. Zwischen Ostbahnhof und Riem besteht Ersatzverkehr. 
• S3: Fährt nur zwischen Mammendorf und Pasing sowie zwischen Giesing (U2) und Holzkirchen.
• S4: Fährt nur zwischen Geltendorf und Pasing.
• S5: Fährt nur zwischen Kreuzstraße und Giesing (U2).
• S6: Fährt nur zwischen Tutzing und Hauptbahnhof (ohne Zwischenhalt ab/bis Pasing) sowie zwischen Trudering (U2) und Ebersberg. Zwischen Ostbahnhof und Trudering (U2) besteht Ersatzverkehr.
• S8: Fährt zwischen Pasing und Ostbahnhof über den Südring ohne Zwischenhalt. Außerdem entfällt der Halt Leuchtenbergring.

S-Bahn-Liniennetz am Instandhaltungswochenende 17. Oktober 2025 (22:20 Uhr), bis 20. Oktober 2025 (4:40 Uhr)

Zwischen Pasing und Hauptbahnhof fahren Ersatzbusse im 10-Minuten-Takt mit Halt an allen Bahnhöfen. Info-Stelen sorgen an den Bushaltestellen und auf dem Weg dorthin für Orientierung und führen mit Hilfe von QR-Codes ergänzend auch per Karten-App zum Ersatzverkehr. Für Fahrten zwischen Pasing und Hauptbahnhof können als deutlich schnellere Alternative ohne Zwischenhalt die S6 und die Regionalzüge genutzt werden. Ergänzend verbindet die MVG-Buslinie 130 Pasing mit der Westendstraße (U4/U5). Auf Bestellung der S-Bahn sind dort größere Fahrzeuge unterwegs und am Samstag fahren die Busse im dichteren 10-Minuten-Takt. Außerdem hat die S-Bahn bei der MVG die Verlängerung der U4 tagsüber von der Theresienwiese bis zur Westendstraße beauftragt, um von dort und vom Heimeranplatz (S2/S7) zusätzliche Fahrtmöglichkeiten zu bieten.

Im östlichen Bereich der Stammstrecke zwischen Hauptbahnhof und Ostbahnhof können alternativ die anderen Verkehrsmittel im MVV genutzt werden, beispielsweise die weitgehend parallel zum Tunnel verlaufende U5.